次世代定序相關技術與專利分析-20191003連結下載
  次世代定序(Next Generation Sequencing,NGS)為建構在一代定序的基礎上所開發出的新技術,其目的是為了將核酸定序(DNA Sequencing),分析特定的DNA片段的鹼基序列的排列方式,目前定序方法有兩種,一種為英國學者Sanger發明的一代定序(Sanger定序),利用聚合酶鏈鎖反應(Polymerase Chain Reaction, PCR)將DNA聚合時的譯碼重新組合後並進行核酸定序,另一種為羅氏公司開發的次世代定序,其原理為將核酸分解成200~500bp不等的片段並接上接頭,再放入帶有接頭互補序列的晶片,最後透過橋式聚合酶鏈鎖反應進行放大,目前已成為生物學、醫學或人類學等領域發展的關鍵技術。
  次世代定序相較於一代定序上,只需要低濃度(較一代低20~60倍)的樣本就可以多10萬倍的數據產量,且次世代定序僅有小於1%的錯誤率,隨著此定序技術的成熟與普及化,此技術發展不再侷限單一物種或基因的方式,而是可以呈現更全面且系統性的生物分析,未來想觀測生物體內的變化更加容易,像是當生物體受到未知病原體入侵時,可以快速定序出感染的關鍵變化,有了快速辨識病原體的技術後,有助於加速臨床研究發展,可以提供資訊來輔助醫師對病人進行治療規劃與藥物選擇,來針對各類疾病或癌症帶動精準醫療的發展,預估未來的五年後,精準醫療市場規模可超過800億美元,而其中次世代定序就扮演著關鍵的角色1。因此本文透過關鍵字「Next Generation Sequencing、NGS」及IPC「C12、A61、G06F2」等,初探全球相關次世代定序的專利技術佈局概況。
一、全球次世代定序相關市場概況
  
近年全球次世代定序之相關技術生命週期(二年期)概況顯示,該技術生命週期分析出依據專利申請數量與專利申請權人數隨時間之消長,觀察次世代定序產業所處之技術生命週期階段,如為:技術萌芽期、成長期、成熟期或是衰退期等。
  如圖一之技術生命週期概況(二年期)顯示,橫軸為專利權人的投入量,縱軸為專利件數的申請量。相關專利的研發投入量自2007-2008年開始成長,在此之前專利數皆少於50件,專利申請人數及專利投入量皆於2017-2018年最高,達1,006人與1,580件,客觀推論目前為技術成長期。

圖一 近年全球次世代定序之相關技術生命周期概況(二年期)

資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理


  近年全球次世代定序之相關專利概況如圖二顯示,相關技術的申請量整體呈成長的趨勢,最終於2017年達到最高點,達923件;專利公開/公告數量整體亦為成長趨勢,最後於2018年達到最高,約為1,223件。

圖二 近年全球次世代定序之相關專利概況
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理


(一)次世代定序近年專利申請與獲證資訊
  
全球次世代定序之專利申請與獲證數量如圖三所示,歷年專利申請數量約為5,057件,其中已獲證的發明專利約1,020件,獲證率約20.79%。

圖三 全球次世代定序之專利申請與獲證數量
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理


(二)全球前五大次世代定序之專利佈局國家或屬地
  
全球前五大次世代定序之專利佈局國家或屬地如圖四所示,其中以US(美國)為最大屬地,占比達29.70%,其餘依序為WO(世界智慧財產組織)、EP(歐洲專利局)、CN(中國)及AU(澳洲)。

圖四 全球前五大次世代定序之專利佈局國家或屬地
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理


二、全球次世代定序相關產業之佈局與所屬競爭者分析
  
下圖五之等高線圖相互比對,分析更細節之技術應用發展,並以高峰表示技術佈局之多寡。探勘近年專利技術的發展主要落在激酶抑制劑、抗體、聚合酶、微生物、染色體、植物基因組、序列及RNA等。

圖五 全球次世代定序之技術佈局
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理


(一)相關所屬競爭者之技術佈局
  
根據圖六及圖七顯示投入該產業技術之標的公司,如Illumina, Inc.以紅色圓點標註,Roche Holding AG以綠色圓點標註,Array BioPharma Inc.以藍色圓點標註,可看出相關標的公司於次世代定序相關技術之分佈概況。

圖六 相關標的公司次世代定序之技術佈局
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理

圖七 相關標的公司佈局次世代定序之技術領域
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理


(二)相關所屬競爭者之引證分析
  
下表顯示次世代定序相關領域中,產業競爭者之TOP 5平均引證分析,其中包含被引證數(Forward Citation)與引證數(Backward Citation)。以次數為基準,被引證最多者為Verinata Health, Inc.,為619次,而引證次數最多者為Array BioPharma Inc.,為5,380次。

表一 產業競爭者之TOP 5平均被引證/引證分析
Forward Citation
Assignee/Applicant Patent Cited Avg.
citation
Verinata Health, Inc. 78 619 7.94
Illumina, Inc. 94 234 2.49
QIAGEN GmbH 91 78 0.86
Roche Holding AG 126 70 0.56
Array BioPharma Inc. 81 39 0.48

 

表一 產業競爭者之TOP 5平均被引證/引證分析
Backward Citation
Assignee/Applicant Patent Cited Avg.
citation
Array BioPharma Inc. 81 5,380 66.42
Illumina, Inc. 94 1,646 17.51
Roche Holding AG 126 1,133 8.99
Verinata Health, Inc. 78 759 9.73
QIAGEN GmbH 91 340 3.74
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理


三、合作專利分類(CPC3分析
  
次世代定序相關技術中,主要CPC技術分類號前五大皆為C12Q組群,其中前五大組群分別為C12Q 1/6869、C12Q 2600/156、C12Q 1/6806、C12Q 1/6886及C12Q 1/6883。
  該些技術涉及定序、遺傳物質或癌症疾病的分析等。再者,透過CPC技術分類號的分析,提供給相關技術領域研發者,可利用此分類號更有效率地縮短前案的檢索搜尋,或比較相關前案技術特徵的時間。

圖八 全球前五大之次世代定序CPC技術分類號分佈
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理

 

表二 CPC技術分類號之詳細說明
CPC Definition
C12Q 1/6869 Methods for sequencing
C12Q 2600/156 Polymorphic or mutational markers
C12Q 1/6806 Preparing nucleic acids for analysis
C12Q 1/6886 for cancer
C12Q 1/6883 for diseases caused by alterations of genetic material
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理

四、全球次世代定序之相關文獻
(一)近5年相關文獻主要涉及議題
  
下圖顯示近5年相關文獻(期刊/會議錄)主要研究之Top 5議題為Pathology(病理科學)、Oncology(腫瘤科學)、Genetics heredity(遺傳學)、Biochemistry molecular biology(生物化學與分子生物學)及Hematology(血液學)。

圖九 近5年文獻探討議題之分佈概況
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理


(二)近5年發佈相關期刊之TOP 5國家/屬地
  
針對近5年發佈相關期刊之TOP 5國家/屬地中,主要以USA(美國)為主,占59.34%。

圖十 近5年發佈相關文獻之TOP 5國家/屬地
資料來源:各國專利局資料庫,華淵公司整理


(三)相關期刊之資訊
  
以下由近5年發佈之期刊中,搜尋出TOP 3引用數之期刊資料,詳如下表。

表三 次世代定序相關文獻一部分期刊資訊
欄  位 文獻一
文獻來源 GENOME RESEARCH,20 (9): 1297-1303 SEP 2010
標  題 The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data
作  者 McKenna, A
被引用數 7,795
國  家 USA

 

表四 次世代定序相關文獻二部分期刊資訊
欄  位 文獻二
文獻來源 NATURE GENETICS,43 (5): 491-+ MAY 2011
標  題 A framework for variation discovery and genotyping using next-generation DNA sequencing data
作  者 DePristo, MA
被引用數 4,491
國  家 USA

 

表五 次世代定序相關文獻三部分期刊資訊
欄  位 文獻三
文獻來源 RICE,6: - 2013
標  題 Improvement of the Oryza sativa Nipponbare reference genome using next generation sequence and optical map data
作  者 Kawahara, Y
被引用數 4,065
國  家 USA

 

註1 NGS 臨床應用陸續通過美國 FDA 核可,帶動精準醫療發展。資料來源
註2 C12:生物化學、啤酒、烈性酒、葡萄酒、醋、微生物學、酶學、突變或遺傳工程;A61:醫學、獸醫學、衛生學;G06F:電子數位資料處理。
註3 CPC:Cooperative Patent Classification
 
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